В Федеральной службе по интеллектуальной собственности зарегистрированы две базы данных о биоразнообразии, созданные сотрудниками Института: "Афиллофороидные грибы Мурманской области" (авторы Ю. Р. Химич, Л. Г. Исаева) и "Водоросли Евро-Арктического региона" (авторы Д. Б. Денисов, А. Л. Косова).
Первая база данных представляет собой набор связанных таблиц, содержащих сведения по образцам афиллофороидных грибов гербария Института проблем промышленной экологии Севера ФИЦ КНЦ РАН (INEP), собранных в ходе работ по изучению лесных экосистем и инвентаризации разнообразия грибов в Мурманской области. Основная ее функция в хранении первичной информации о встречаемости афиллофороидных грибов в Мурманской области.
База данных "Водоросли Евро-Арктического региона" представляет собой удобный инструмент для работы с разнородными данными по водорослям региона. Она позволяет решать следующие задачи: 1. хранение и систематизация данных ранних и современных исследований водорослей; 2. обеспечение удобного внесения данных пользователями; 3. оптимизация аналитической работы – интеграция экологических характеристик водорослей, удобный импорт и экспорт данных в среде MS Office.