В Федеральной службе по интеллектуальной собственности зарегистрированы две базы данных о биоразнообразии, созданные сотрудниками Института: «Зоопланктон Евро-Арктического региона» (авторы О. И. Вандыш, С. В. Постнова, А. А. Черепанов) и «Мохообразные гербария ИППЭС КНЦ РАН (INEP)» (автор Е. А. Боровичев).
Первая база данных содержит сведения о разнообразии сообществ зоопланктона пресноводных водоемов Евро-Арктического региона. Для каждой пробы указаны: порядковый номер, дата отбора, объект исследования (водоем), местоположение створа (станция), температура воды, горизонт лова, объем профильтрованной воды, орудие лова, основные количественные характеристики зоопланктона (численность, биомасса, продукция, индексы, коэффициенты). В настоящее время в базе данных содержится информация о сообществах зоопланктона 112 водоемов Мурманской области. Наиболее полные сведения и длинные ряды многолетних наблюдений (с 1990 по 2019 гг.) имеются по оз. Имандра и озерно-речной системе Паз.
База данных «Мохообразные гербария ИППЭС КНЦ РАН (INEP)» представляет собой набор таблиц, содержащий сведения о гербарных образцах мохообразных (мхах и печеночниках), хранящихся в гербарии Института проблем промышленной экологии Севера ФИЦ КНЦ РАН (INEP). На март 2020 г. базе данных содержалась информация о 2100 образцах в основном из Мурманской области. Наиболее значительны коллекции с территории заповедника «Пасвик», памятников природы регионального значения как существующих, так и проектируемых. Все образцы имеют координаты (географическую привязку).
